Babak kedua dimulai, Bayern Munchen masih mengendalikan permainan dengan penguasaan bola dan juga serangan ke tim tamu. Kingsley Coman membuat pendukung tuan rumah kembali bersorak saat tendangannya berhasil menjebol gawang Borussia Dortmund. Leroy Sane kembali berperan atas terciptanya gol ini, menguasai bola di sector kiri pertahanan Dortmund, Sane dengan kaki kirinya mengirim umpan mendatar terukur ke sisi kanan gawang, bek kanan Dortmund Marius Wolf tidak mengira ada Kingsley Coman yang berlari dari arah belakangnya dan langsung mencocor bola dengan kaki kirinya, walau sempat mengenai tangan penjaga gawang Gregory Kobel namun bola tidak tertahan dan masuk gawang. 4-0 Bayern Munchen unggul.
Menit ke 58 penyerang Eric Maxim Choupo-Moting membuat gol indah, menerima umpan dari Joshua Kimmich, Choupo-Moting menahan dengan dada kemudian membuat tendangan salto yang tidak bisa di tahan oleh Kobel, namuan sayang golnya dianulir karena Choupo-Moting berada dalam posisi offside.
Borussia Dortmund akhirnya isa memperkecil ketertinggalan melalui gol yang dibuat Emre Can dari titik pinalti menit ke 71. Pinalti didapat setelah Jude Bellingham dilanggar oleh Serge Gnabry di kotak pinalti. 4-1 masih untuk keunggulan Bayern Munchen.
Pemain pengganti Jamal Musiala dan Serge Gnarbry beberapa kali mengancam gawang Dortmund, satu gol yang dibuat Gnarbry menit ke 84 dianulir wasit karena gnarbry berada dalam posisi offside saat menerima umpan terobosan.
Tim tamu mendapat gol dimenit ke 90 yang dibuat pemain pengganti Donyell Malen. Skor 4-2 bertahan sampai pertandingan berakhir.
